DNNESCAN has discovered 75 putative TFBSs for 1 TF proteins in 99 genomic regions. See scan settings.

Discovered TFBSs

#Chr Promoter ID TF Strand Kmer ID Kmer Rel. Start Rel. End Abs. Start Abs. End
2 IGR_Upstream_YBL047C REB1(motif, model) - 261 TTACCCGT 261 268 132301 132308
2 IGR_Upstream_YBL036C REB1(motif, model) + 131 TTACCCGG 131 138 151351 151358
2 IGR_Upstream_YBR081C REB1(motif, model) + 235 TTACCCGT 235 242 405486 405493
2 IGR_Upstream_YBR130C REB1(motif, model) - 159 TTACCCGC 159 166 497028 497035
2 IGR_Upstream_YBR179C REB1(motif, model) + 180 TTACCCGG 180 187 589294 589301
2 IGR_Upstream_YBR236C REB1(motif, model) + 133 TTACCCGG 133 140 691826 691833
3 IGR_Upstream_YCR067C REB1(motif, model) + 649 TTACCCGC 649 656 236971 236978
4 IGR_Upstream_YDL226C REB1(motif, model) - 125 TTACCCGC 125 132 52298 52305
4 IGR_Upstream_YDL213C REB1(motif, model) - 125 TTACCCGG 125 132 78091 78098
4 IGR_Upstream_YDL209C REB1(motif, model) + 115 TTACCCGC 115 122 87341 87348
4 IGR_Upstream_YDL174C REB1(motif, model) + 477 TTACCCTG 477 484 148066 148073
4 IGR_Upstream_YDL140C REB1(motif, model) - 705 TTACCCGC 705 712 211266 211273
4 IGR_Upstream_YDR155C REB1(motif, model) - 357 TTACCCGC 357 364 769357 769364
4 IGR_Upstream_YDR155C REB1(motif, model) - 377 TTACCCGT 377 384 769377 769384
4 IGR_Upstream_YDR173C REB1(motif, model) + 194 TTACCCGA 194 201 811826 811833
4 IGR_Upstream_YDR190C REB1(motif, model) + 165 TTACCCGC 165 172 842160 842167
4 IGR_Upstream_YDR313C REB1(motif, model) + 179 TTACCCGG 179 186 1090258 1090265
5 IGR_Upstream_YER039C-A REB1(motif, model) + 115 TTACCCGG 115 122 229596 229603
7 IGR_Upstream_YGL245W REB1(motif, model) + 115 TTACCCGA 115 122 38895 38902
7 IGR_Upstream_YGL237C REB1(motif, model) - 177 TTACCCGG 177 184 53705 53712
7 IGR_Upstream_YGL200C REB1(motif, model) + 175 TTACCCGG 175 182 123480 123487
7 IGR_Upstream_YGL161C REB1(motif, model) - 180 TTACCCGG 180 187 200322 200329
7 IGR_Upstream_YGL089C REB1(motif, model) + 693 TTACCCGC 693 700 345846 345853
7 IGR_Upstream_YGL070C REB1(motif, model) + 128 TTACCCGC 128 135 374955 374962
7 IGR_Upstream_YGR010W REB1(motif, model) - 164 TTACCCGT 164 171 511166 511173
7 IGR_Upstream_YGR132C REB1(motif, model) + 175 TTACCCGT 175 182 756627 756634
7 IGR_Upstream_YGR132C REB1(motif, model) - 378 TAACCCGG 378 385 756830 756837
7 IGR_Upstream_YGR179C REB1(motif, model) - 136 TTACCCGG 136 143 855031 855038
7 IGR_Upstream_tG(GCC)G2 REB1(motif, model) + 1166 TTACCCGG 1166 1173 932118 932125
7 IGR_Upstream_YGR231C REB1(motif, model) + 362 TTACCCGG 362 369 953842 953849
8 IGR_Upstream_YHL031C REB1(motif, model) + 438 TTACCCGG 438 445 39924 39931
9 IGR_Upstream_YIL149C REB1(motif, model) - 237 TTACCCGG 237 244 68304 68311
10 IGR_Upstream_YJL196C REB1(motif, model) - 153 TTACCCGC 153 160 68935 68942
10 IGR_Upstream_YJL044C REB1(motif, model) - 188 TTACCCGC 188 195 359864 359871
10 IGR_Upstream_YJR085C REB1(motif, model) + 490 TTACCCGG 490 497 585927 585934
10 IGR_Upstream_YJR098C REB1(motif, model) + 168 TTACCCGG 168 175 615324 615331
10 IGR_Upstream_YJR137C REB1(motif, model) + 345 TTACCCGG 345 352 683630 683637
11 IGR_Upstream_YKL146W REB1(motif, model) + 520 TTACCCGG 520 527 171649 171656
11 IGR_Upstream_YKL082C REB1(motif, model) - 386 TTACCCTG 386 393 282715 282722
11 IGR_Upstream_YKL052C REB1(motif, model) + 201 TTACCCGC 201 208 340747 340754
11 IGR_Upstream_YKR068C REB1(motif, model) - 131 TTACCCGG 131 138 571040 571047
12 IGR_Upstream_YLL050C REB1(motif, model) + 139 TTACCCGG 139 146 40553 40560
12 IGR_Upstream_YLR170C REB1(motif, model) + 140 TTACCCGA 140 147 501189 501196
12 IGR_Upstream_YLR309C REB1(motif, model) - 127 TTACCCGC 127 134 751896 751903
13 IGR_Upstream_YML124C REB1(motif, model) - 126 TTACCCGA 126 133 23809 23816
13 IGR_Upstream_YML081C-A REB1(motif, model) - 358 TTACCCGG 358 365 104520 104527
13 IGR_Upstream_YMR039C REB1(motif, model) + 470 TTACCCGG 470 477 349992 349999
13 IGR_Upstream_YMR047C REB1(motif, model) - 164 TTACCCGG 164 171 366869 366876
13 IGR_Upstream_YMR185W REB1(motif, model) + 100 TTACCCGC 100 107 628885 628892
13 IGR_Upstream_YMR221C REB1(motif, model) + 118 TTACCCGG 118 125 715563 715570
13 IGR_Upstream_YMR280C REB1(motif, model) - 784 TTACCCGG 784 791 832113 832120
14 IGR_Upstream_YNL308C REB1(motif, model) - 131 TTACCCGG 131 138 56028 56035
14 IGR_Upstream_YNL284C REB1(motif, model) - 67 TTACCCGG 67 74 104169 104176
14 IGR_Upstream_YNL280C REB1(motif, model) - 311 TTACCCGG 311 318 110722 110729
14 IGR_Upstream_YNL244C REB1(motif, model) + 191 TTACCCGA 191 198 187687 187694
14 IGR_Upstream_YNL118C REB1(motif, model) - 202 TTACCCTG 202 209 405766 405773
14 IGR_Upstream_YNL111C REB1(motif, model) + 344 TTACCCGC 344 351 417646 417653
14 IGR_Upstream_YNL091W REB1(motif, model) + 69 TTACCCGC 69 76 452142 452149
14 IGR_Upstream_YNL008C REB1(motif, model) - 115 TTACCCTG 115 122 618356 618363
14 IGR_Upstream_YNR013C REB1(motif, model) - 223 TTACCCGG 223 230 651935 651942
15 IGR_Upstream_YOL006C REB1(motif, model) + 279 TTACCCGG 279 286 315666 315673
15 IGR_Upstream_YOR048C REB1(motif, model) + 143 TTACCCGA 143 150 421793 421800
15 IGR_Upstream_YOR093C REB1(motif, model) + 158 TTACCCGT 158 165 502610 502617
15 IGR_Upstream_YOR116C REB1(motif, model) + 703 TTACCCGG 703 710 544848 544855
15 IGR_Upstream_YOR122C REB1(motif, model) - 126 TTACCCGC 126 133 553013 553020
15 IGR_Upstream_YOR148C REB1(motif, model) - 115 TTACCCGA 115 122 609312 609319
15 IGR_Upstream_YOR151C REB1(motif, model) - 399 TTACCCTG 399 406 617070 617077
15 IGR_Upstream_YOR157C REB1(motif, model) - 162 TAACCCGG 162 169 631913 631920
15 IGR_Upstream_YOR157C REB1(motif, model) + 194 TTACCCGC 194 201 631945 631952
15 IGR_Upstream_YOR324C REB1(motif, model) + 347 TTACCCGA 347 354 925387 925394
15 IGR_Upstream_YOR353C REB1(motif, model) + 119 TTACCCGA 119 126 1000947 1000954
16 IGR_Upstream_YPL212C REB1(motif, model) + 169 TTACCCGC 169 176 153318 153325
16 IGR_Upstream_YPR025C REB1(motif, model) + 106 TTACCCGG 106 113 614664 614671
16 IGR_Upstream_YPR074C REB1(motif, model) + 379 TTACCCGC 379 386 695217 695224
16 IGR_Upstream_YPR163C REB1(motif, model) + 584 TTACCCGC 584 591 870539 870546

TF Motifs


  • REB1
    		•

    DNNESCAN Models

    DNNESCAN Settings

    Operation: scan
    TF protein(s): reb1
    Input file format: genes
    Output format: html
    Overlapping removal: all